في هذه المرحلة، يتم تنفيذ العمليات الأساسية للعلاج، وهي تنمية البويضات وتكوين الأجنة. تتلقى المرأة علاجًا هرمونيًا لمدة 10-12 يومًا لتحفيز إنتاج عدد كبير من البويضات، ويتم متابعة هذه العملية عن كثب بواسطة الموجات فوق الصوتية. تُجمع البويضات الناضجة تحت التخدير، ثم تُخصب في المختبر بواسطة الحيوانات المنوية (ICSI) لتكوين الأجنة. تُراقب الأجنة لمدة 3 إلى 5 أيام لاختيار أفضلها جودة؛ وإذا لزم الأمر، يتم تطبيق عملية الفقس المساعد (Assisted Hatching) لدعم عملية الانغراس.

في هذه المرحلة، وهي المرحلة النهائية للعلاج، يتم نقل أفضل جنين أو الأجنة المختارة في المختبر إلى رحم الأم عبر إجراء غير مؤلم. بعد هذا النقل، يُعطى الزوجان أدوية داعمة مثل البروجسترون (دعم المرحلة الأصفرية) لتحضير بطانة الرحم وزيادة فرصة انغراس الجنين. يدخل الزوجان فترة حرجة ينتظران خلالها انغراس الجنين في الرحم. بعد حوالي 10-12 يومًا من النقل، يتم إجراء اختبار الدم لبيتا-hCG لتحديد ما إذا تم الحمل أم لا. في حال كانت نتيجة الاختبار إيجابية، يتم متابعة الحمل بشكل منتظم.